根据国务院学位委员会学科评议组审核《授予博士、硕士学位和培养研究生的学科、专业目录》,生物医學工程(083100)只设一级学科,不分设二级学科,但各高校可结合学科发展方向自主设置二级学科,东南大学在生物医學工程一级学科下自主设置神经信息工程、生物信息技术、医学影像与医学电子学、生物医学纳米技术、生物医学材料与器件等5个二级学科。
1、神經信息工程:研究學習的規律,研究學生如何有效地從原有知識和能力,向新知識和能力的轉移。
2、生物信息技術:實現生物技術和信息技術以及其他學科的有機結合,發展生物信息高通量、高效、快速的提取方法,發展疾病檢測的新方法和新技術,發展研究藥物與靶標作用的新方法,發展基因組數據、蛋白質組數據和結構基因組數據的計算機處理、分析和可視化方法,解析生物大分子結構和功能之間關系等,提高生物信息處理、分析和利用的水平,爲我國生命科學和生物技術的源頭創新奠定基礎。
3、醫學影像與醫學電子學:醫學圖像處理和分析、計算機輔助診斷和治療、醫學物理等,以及生物、醫學和工程學等領域理論和方法,並通過這些學科的交叉形成了新型學科。
4、生物醫學納米技術:包括納米生物材料、納米生物器件研究、納米生物技術在臨床診療中的應用、納米材料與器件的計算模擬。
5、生物傳感芯片與生物醫學器件:生物醫用材料研究,用于人體、器官的診斷、修複、替換或增進其功能。